Al principio sólo fue una sencilla ermita hecha de adobe, a la que acudían los neo feligreses ávidos de la enseñanza religiosa; luego se erigió una iglesia en forma que más tarde sería remodelada, hasta lo que se conoce actualmente como el templo de Santo Tomás.

Situado en el Anillo de Circunvalación, entre las calles de Gómez Pedraza y Plaza Carrizal, en la colonia Centro, este inmueble probablemente fue edificado por los religiosos Agustinos en el siglo XVI.

Lamentablemente, se cuenta con escasa información acerca de cómo fue construido y los detalles originales que tenía.

Su primer párroco secular fue Cristóbal Folgar, quien trasladó la entonces humilde capilla al lugar que ahora ocupa, por lo que empezó la construcción del templo en 1782.

Posteriormente, en el siglo XIX fue remodelado: el techo estaba dividido en bodega y envigado, fue entonces cuando se añadió al atrio un muro con arcos invertidos y un pórtico. Fue reabierto al culto público el 21 de octubre de 1861.

La portada de la iglesia presenta un acceso con arco de medio punto enmarcado con pares de pilastras almohadilladas, en cuyos espacios aparecen nichos con varias esculturas.

Por su parte el arquitrabe está moldurado, mientras que el friso se halla labrado con algunos motivos vegetales.

En el segundo cuerpo existe un relieve de Cristo crucificado, surgiendo entre cortinajes sostenidos por dos ángeles, lo que otorga un toque celestial y bastante peculiar al decorado interior.

Precisamente en esta parte, un par de espíritus celestiales portan símbolos representativos de la Pasión de Jesús. La cornisa del entablamento se resuelve en un frontón de perfil mixtilíneo.

El mayor cambio que se ha realizado a la fecha, consistió en modificar el piso original por mármol en 1967; de igual manera, se restauraron el entrepiso y la techedumbre.

Pese a no tener mayores datos que pudieran ilustrar en forma más puntual la historia de este inmueble, está considerado como histórico y por ende, registra un carácter importante dentro del Patrimonio Inmobiliario Federal. .